水肿之证，先由脾肾阳虚，不能制水，水溢皮肤而为肿。其本在肾，其标在肺，其制在脾。治法当先灸命关、关元各三百壮，以固脾肾之气；内服金液丹、草神丹，以温阳化气；外用葱白熨法，以通阳气。若不灸而徒恃汤药，则十无一生。
又有水气凌心之证，其证喘促不得卧，胸腹胀满，四肢浮肿，唇青鼻黑，此肾水泛滥，上凌于心也。当急灸命关、关元各五百壮，服金液丹、姜附汤，若不急救，必死。
又有久病之后，或产后失调，致成水肿者，此脾肾大虚，水湿不化。当灸命关三百壮，服草神丹，兼服四神丹，徐徐调治，不可骤攻。
又有虚肿之证，其状如肿而按之不陷，皮肤宽纵，目下浮肿如卧蚕状，此脾虚失运，肺虚失布，肾虚失化也。当灸命关二百壮，服补中益气汤、金液丹，兼服五苓散以利水。
水肿基本证治：水肿这种病，首先是因为脾肾阳虚，不能制约水液运行，水湿泛滥溢于皮肤而形成了肿胀。其根本在肾脏（肾主水），其表现在肺脏（肺主皮毛、通调水道），其制约在脾脏（脾主运化水湿）。正确的治疗方法是先灸命关穴、关元穴各三百壮，以巩固脾肾的阳气；内服金液丹、草神丹，以温补阳气、化气行水；外用葱白熨法，以通畅阳气、促进气化。如果不用艾灸而单纯依靠汤药，则十个病人中没有一个能存活。
水气凌心证（危重症）：还有一种情况是水气上逆侵犯心脏，其症状表现为气喘急促不能平卧，胸部和腹部胀满，四肢浮肿，口唇发青、鼻头色黑。这是肾水泛滥，向上侵犯心脏所致。应当紧急灸命关、关元各五百壮，同时服用金液丹、姜附汤。如果不紧急救治，病人必然死亡。
久病产后水肿：又有久病之后，或产后调养不当，导致水肿的，这是脾肾严重虚弱，水湿不能正常运化所致。应当灸命关三百壮，服用草神丹，兼服四神丹，慢慢调理治疗，不能急于攻逐水饮。
虚肿证：还有虚肿的证候，其外形像肿但按压时不凹陷，皮肤松弛宽缓，眼皮下发肿像卧蚕一样。这是脾虚不能运化、肺虚不能布散、肾虚不能气化所致。应当灸命关二百壮，服用补中益气汤、金液丹，兼服五苓散以利水渗湿。
窦材论水肿，继承了《内经》"诸湿肿满，皆属于脾""其本在肾，其末在肺"的理论，但更加强调阳气在水肿发病中的核心地位。他指出水肿的根本原因在于脾肾阳虚，不能制水。这一观点与其一贯的"扶阳"思想完全一致——阳气是人体生命活动的根本动力，阳气不足则水湿不能化、不能行、不能布，停聚而为水肿。
肾（其本在肾）：肾主水，司气化。肾阳为一身阳气之根，肾阳不足则气化失司，水液不能蒸腾气化，下不能排出，上不能输布，泛滥而为肿。肾虚是水肿的根本原因。
肺（其标在肺）：肺主皮毛，通调水道，为水之上源。肺气不足或外邪束肺，则水道不通，水液不能正常布散，溢于皮肤而肿。肺是水肿的表现部位和影响因素。
脾（其制在脾）：脾主运化水湿，为水液代谢的中枢。脾阳虚则运化失职，水湿内停，泛滥肌肤。脾是控制水肿的关键脏腑。
三脏之中，窦材特别强调脾肾二脏。脾为后天之本，肾为先天之本，二脏阳气充足，则水湿自化。故治水肿当以温补脾肾阳气为第一要义。
窦材治疗水肿最突出的特色是灸法为主，药物为辅。他明确断言："若不灸而徒恃汤药，则十无一生。"这一论断在当时具有极强的针对性和批判性——宋代医界普遍重视方药而轻视灸法，窦材则反复强调艾灸在脾肾阳虚类疾病中的不可替代作用。
窦材特别提出"水气凌心"这一危重证候，其表现包括：喘促不得卧、胸腹胀满、四肢浮肿、唇青鼻黑。这是肾水泛滥，向上侵犯心脏的表现，相当于现代医学的"心源性水肿伴有心功能不全"或"肺水肿"。
其病机为：肾阳衰微，不能化气行水，水湿泛滥上逆。水气上凌心肺，导致心肺功能严重受损。窦材对此证的治法是急灸命关、关元各五百壮，比普通水肿增加了灸量，以示危急。同时内服金液丹、姜附汤大剂温阳。
唇青鼻黑是阳气大衰、血行瘀滞的危险标志，见此证者当以急救为先，不可犹豫。
窦材将"虚肿"作为一个独立证型提出，与一般水肿进行了鉴别。虚肿的特点是按之不陷（区别于一般水肿的按之凹陷）、皮肤宽纵、目下如卧蚕。这是脾肺肾三脏俱虚的表现，治疗上除了温补脾肾之外，还加用了补中益气汤以补肺气、五苓散以利水渗湿，体现了窦材在扶阳大法下的灵活用药。
与后世医家多从风邪外袭、水湿内停、湿热壅盛等角度认识水肿不同，窦材认为水肿的核心病机是脾肾阳虚，不能制水。即便是外感引发的水肿，其内在的基础仍是阳气不足。因此，温补脾肾阳气是治疗水肿的根本大法。
窦材治水肿，灸法是首选、必选。命关（食窦）大补脾土，关元温补肾阳，二穴配合灸治，脾肾双补。窦材强调"若不灸而徒恃汤药，则十无一生"，将灸法的地位提到了前所未有的高度。灸量方面，普通水肿三百壮，水气凌心五百壮，体现了"大病宜重灸"的思想。
水气凌心证表现为喘促不得卧、胸腹胀满、唇青鼻黑，其病机为肾水泛滥上凌心肺。窦材指出此证必须急灸五百壮并用大剂温阳药物急救，否则必死。这一认识对于现代临床处理心源性水肿、肺水肿等危重症仍然具有重要参考价值。
对于久病之后或产后失调导致的水肿，窦材强调脾肾大虚，不可用峻猛的攻逐水饮之法，而应当徐徐调治，以温补为主。这一原则对于慢性水肿和虚性水肿的治疗具有重要指导意义。
窦材将虚肿作为一个独立证型，其特征为按之不陷、皮肤宽纵、目下如卧蚕。治疗在温补脾肾的基础上，加用补中益气汤和五苓散，体现了辨证论治的灵活性。
窦材治疗水肿的思路，对现代临床中以下类型的水肿具有重要参考价值：
窦材对水肿的辨治给现代临床提供了重要的鉴别诊断思路：