小儿痢疾，盖因饮食不节，损伤脾胃，或风冷暑湿之气乘虚而入，以致气血不和，停滞肠胃，遂成痢疾。其证大便频数，里急后重，下痢赤白，或如鱼脑，或如豆汁，或纯下鲜血。治法：当先灸命关、关元各三百壮，以扶阳气，散寒湿；再服金液丹、四神丹，以温补下元，固涩肠道。若下痢纯血者，难治；下痢如屋漏水，或如猪肝色者，皆死证也。小儿体弱，不可轻用寒凉攻下之药，恐伤正气，反致不救。
又有一证，小儿因中气虚寒，饮食难化，积滞肠间，致成休息痢，时作时止，延久不愈。治法亦宜灸命关、关元，服金液丹，更以参术散调之，缓缓取效，不可求速。
小儿痢疾，大多是因为饮食不知节制，损伤了脾胃功能，或是风、冷、暑、湿等外邪乘人体虚弱之时侵入，导致气血运行失调，病邪停滞在肠胃之中，从而形成了痢疾。其症状表现为：大便次数频繁，肛门有下坠感（里急后重），排出的大便中夹杂红白黏液（赤白痢），有的像鱼脑状，有的像豆汁样，有的甚至全是鲜血。
治疗方法：应当首先艾灸命关和关元穴，每穴各三百壮，用来扶助阳气、驱散寒湿；再服用金液丹、四神丹等温补丹药，以温暖补益下焦元气，固涩肠道。如果下痢全是鲜血的，难以治疗；下痢如房顶漏下的雨水一样稀薄，或像猪肝颜色一样暗黑的，都是死证。小儿体质虚弱，不可轻易使用寒凉攻下的药物，恐怕损伤正气，反而导致无法救治。
又有一种情况，小儿因为中气虚弱、体内有寒，饮食难以消化，食物积滞在肠道中，形成了休息痢（慢性痢疾），时好时发，拖延很久不愈。治法也应当艾灸命关和关元穴，服用金液丹，再配合参术散来调理，慢慢取效，不可急于求成。
本篇是窦材论述小儿痢疾的专篇，集中体现了其"扶阳为本、灸药并用"的学术特点。窦材认为小儿痢疾的病机核心在于脾胃虚寒、阳气不足，导致寒湿之邪停滞肠道，气血运行失常而发病。这与当时主流医学多以湿热论治痢疾的思路形成鲜明对比。
窦材特别指出，小儿痢疾的治疗不可轻用寒凉攻下。他认为小儿脏腑娇嫩、阳气未充，若滥用黄连、大黄等苦寒之药，或妄用承气汤等下法，必然进一步损伤脾胃阳气，使正气更虚、邪气更盛，病情反而加重。这与《伤寒论》中"下利清谷不止，身疼痛者，急当救里"的思路一脉相承。
文中将小儿痢疾分为急性（新病）和慢性（休息痢）两种，均以灸法为核心治法，辅以温补丹药。对于出现"纯下鲜血""下痢如屋漏水""如猪肝色"等危重证候，窦材明确指出预后不良，体现了其实事求是的临床态度。
窦材治疗小儿痢疾的思路，与其"保命之法：灼艾第一，丹药第二，附子第三"的核心理念完全一致。灸命关（即食窦穴，位于胸部）和关元（脐下三寸），是窦材治疗一切虚寒性胃肠疾病的常用配穴。命关穴窦材认为能"接真气、补脾胃"，关元穴则是"小肠之募、足三阴之会"，灸之可温补下元、散寒止痢。三百壮的重灸量，在儿科使用中需结合睡圣散以减轻患儿痛苦，也体现了窦材对灸法效果的坚定信念。
金液丹（主要成分为硫黄经特殊炮制）和四神丹（含硫黄、雄黄、朱砂等）均为窦材常用的温补丹药，其性大热，用于治疗虚寒性痢疾确有奇效。但需要注意的是，这些丹药的热性极强，必须确属虚寒证方可使用，不可滥用。窦材对丹药的精通和广泛使用，是其学术的一大特色。
对于小儿痢疾，现代临床多以感染性痢疾（细菌性痢疾、阿米巴痢疾）为常见，治疗以抗感染和对症支持为主。窦材的方法特别适用于慢性、虚寒性的痢疾患者（如久痢不愈、脾胃虚寒、阳气不足者），以及抗生素治疗后肠道功能紊乱、腹泻迁延的患儿，在辨证准确的前提下，灸法和温补法有其独特的临床价值。
窦材治疗小儿痢疾的方法，在现代临床中仍有重要参考价值，尤其适用于虚寒型痢疾及久痢不愈的患儿。以下是具体的临床应用分析：
张仲景《伤寒论》："下利便脓血者，桃花汤主之。"——以赤石脂、干姜、粳米温中涩肠，与窦材温补固涩的思路相通，但张仲景以方药为主，窦材则以灸法和丹药为主，各有所长。
《小儿药证直诀》钱乙："小儿痢疾，多因乳食不节，或感受寒暑，冷热不调，故成痢也。"——钱乙对病因的认识与窦材相近，但在治疗上钱乙更重视分型论治（冷痢、热痢、疳痢等），而窦材则统一以扶阳为纲。
《景岳全书》张介宾："凡治痢疾，最当察虚实，辨寒热。若脉证俱实，而邪气有余者，可清可利；若脉证俱虚，而正气不足者，当温当补。"——张介宾强调虚实寒热之辨，与窦材专主虚寒的立场可互为补充。