咳嗽是中医临床常见病证，有声无痰为咳，有痰无声为嗽，一般多痰声并见，故以咳嗽并称。《扁鹊心书》卷下第九十专论咳嗽，窦材将咳嗽分为三证论治：肺感风寒证、外寒内伤证、肾虚烦躁证，并特别强调劳咳的危重证候与急救方法。窦材论咳嗽的核心思想在于"忌凉药、重扶阳"，认为咳嗽切忌滥用寒凉药物，否则会导致肺气冰伏、脾肾虚败，变生他证。
"咳嗽多清涕者，肺感风寒也，华盖散主之。若外感风寒，内伤生冷，令人胸膈作痞，咳而呕吐，五膈散主之。咳嗽烦躁者，属肾，石膏丸主之。大凡咳嗽者，忌服凉药，犯之必变他证，忌房事，恐变虚劳。久咳而额上汗出，或四肢有时微冷，间发热困倦者，乃劳咳也。急灸关元三百壮，服金液丹、保命丹、姜附汤，须早治之，迟则难救。"
附：咳病（第九十一，与灸天突相关）
"此证方书名为哮喘，因天寒饮冷，或过食盐物，伤其肺气，故喉常如风吼声，若作劳则气喘而满。须灸天突穴五十壮，重者灸中脘穴五十壮，服五膈散，或研蚯蚓二条，醋调服立愈。"
咳嗽篇：咳嗽而伴有较多清稀鼻涕的，属于肺感受风寒所致，用华盖散主治。如果外感风寒又内伤生冷饮食，导致胸膈痞闷不舒、咳嗽并伴有呕吐的，用五膈散主治。咳嗽而烦躁不安的，属于肾的病变，用石膏丸主治。大凡咳嗽的患者，禁忌服用寒凉药物，犯了禁忌必然变生其他病证；禁忌房事，否则恐怕转变为虚劳。长久咳嗽而出现额头出汗，或者四肢有时微微发冷，间或发热困倦的，这是劳咳。应当立即急灸关元穴三百壮，并服用金液丹、保命丹、姜附汤，必须及早治疗，晚了就难以救治。
咳病篇：这种病医书称之为哮喘，是因为天气寒冷时饮冷，或者过食盐味物品，损伤了肺气，所以喉咙中常常像有风在吼叫的声音，如果劳累就会气喘而胸满。必须灸天突穴五十壮，严重的灸中脘穴五十壮，服用五膈散，或者将两条蚯蚓研末，用醋调服可以立刻痊愈。
肺主皮毛，开窍于鼻。风寒外袭，首犯肺卫，肺气失宣故咳嗽；寒邪未化热，故鼻涕清稀。窦材以华盖散主之，华盖散出自《太平惠民和剂局方》，由麻黄、杏仁、甘草、桑白皮、紫苏子、赤茯苓、陈皮组成，功能宣肺散寒、化痰止咳。方名"华盖"，取肺为五脏华盖之义。
此证为外感风寒与内伤生冷相合，表里同病。寒邪客于胸膈，气机阻滞则痞闷不舒；寒邪犯胃，胃气上逆则咳而呕吐。窦材选用五膈散治之。五膈散出自《太平惠民和剂局方》，由枳壳、木香、丁香、青皮、陈皮、大腹皮、白术、茯苓、半夏、甘草、干姜等组成，功能温中散寒、理气和胃、降逆止呕。
肺感风寒与外寒内伤之区别：前者病位偏表在肺，以咳嗽清涕为主症；后者表里同病，在咳嗽基础上兼有胸痞、呕吐等胃肠症状。前者治在宣肺，后者兼需温中和胃。
窦材提出"咳嗽烦躁者，属肾"，这是非常独到的见解。一般医家见咳嗽多从肺治，但窦材指出，若咳嗽伴见烦躁不安，病根在肾。肾主纳气，肾虚则气不归元，浮越于上，故咳而烦躁。石膏丸由石膏、寒水石等组成，功能清泻肺肾之热。但需注意，此处石膏丸之用在于肾经郁热，非虚寒证，窦材虽以扶阳为宗，但亦不废清热，体现了辨证论治的精神。
久咳不愈，出现额上汗出（又称"额汗"，为虚阳外越之征）、四肢微冷（阳气不能达于四末）、发热困倦（阴虚阳浮），这是"劳咳"，即虚劳性咳嗽，病已深入心肾，是危重证候。窦材主张立即灸关元穴三百壮以急救，关元为任脉与足三阴经交会穴，是人体元阴元阳之关，大灸关元能挽回欲脱之阳气。同时内服金液丹（硫黄制剂，大热纯阳之品）、保命丹、姜附汤（干姜、附子），一派温补，迟则难救。
窦材在咳病篇中论哮喘，认为是因寒饮冷或过食盐物伤肺所致，灸天突穴五十壮。天突穴位于胸骨上窝正中，属任脉，为肺之门户，灸之能降逆化痰、宣通肺气。重者加灸中脘穴以健脾化痰，培土生金。
窦材认为咳嗽的治疗关键在于辨别寒热虚实，切忌一见咳嗽便用黄芩、知母、桑白皮、杏仁等寒凉药，否则会导致"肺气冰伏，脾肾虚败"。即使后期用补，也不过是四君子汤、六味地黄丸等和平之剂，所谓"养杀而已"——表面上在调养，实则延误病情，如慢性杀害。这种批判直指时医滥用寒凉、延误病机的流弊。
风寒咳嗽：咳嗽声重、痰白清稀、鼻塞流清涕、恶寒发热、舌苔薄白、脉浮紧
外寒内伤咳嗽：咳嗽兼胸膈痞闷、恶心呕吐、脘腹胀满、舌苔白腻
肾虚烦躁咳嗽：咳嗽伴心烦易怒、手足心热或烦躁不安、舌红少苔、脉细数
劳咳（虚极）：久咳不愈、额汗出、四肢冷、发热困倦、脉虚数无力
窦材特别强调咳嗽中"寒热真假"的辨别：咳嗽烦躁看似热证，但若伴有四肢微冷、困倦乏力，实为虚阳外越，不可误用寒凉。真正的热证咳嗽少见，多数咳嗽属寒或虚实夹杂，当以温法为主。
轻证：新咳、咳声有力、无全身症状——可投方药观察
中证：咳嗽日久、伴有胸痞呕恶——需表里同治
危证（劳咳）：久咳额汗、四肢冷、困倦发热——急灸关元，汤药并进
穴位：关元穴（脐下三寸，任脉）
灸量：三百壮（大灸量，分次完成或直接大艾炷灸）
主治：久咳额上汗出、四肢微冷、发热困倦之劳咳危证
机制：关元为人体元阴元阳之关，灸之大补元气、回阳固脱，使阳气回复则咳喘自平。
穴位：天突穴（胸骨上窝正中，任脉）
灸量：五十壮
主治：因寒饮冷或过食盐物所致之哮喘、咳嗽，喉中痰鸣如风吼声
机制：天突为肺之门户，灸之能降逆化痰、宣通肺气、利咽喉。
穴位：中脘穴（脐上四寸，任脉）
灸量：五十壮
主治：哮喘重症，脾虚痰盛者
机制：中脘为胃之募穴、腑会，灸之健脾化痰、培土生金。
组成：麻黄、杏仁、甘草、桑白皮、紫苏子、赤茯苓、陈皮
功效：宣肺散寒、化痰止咳
方解：麻黄宣肺散寒为君；杏仁、苏子降气化痰为臣；桑白皮清肺、赤茯苓利湿、陈皮理气为佐；甘草调和诸药为使。全方宣降并用，重在恢复肺气宣发肃降之职。
组成：枳壳、木香、丁香、青皮、陈皮、大腹皮、白术、茯苓、半夏、甘草、干姜
功效：温中散寒、理气和胃、降逆止呕
方解：干姜温中散寒为君；木香、丁香、青皮、陈皮理气宽中为臣；枳壳、大腹皮行气消痞，白术、茯苓健脾渗湿，半夏降逆止呕为佐；甘草调和诸药为使。表里同治，重在温中。
组成：石膏、寒水石等（原方组成详参《扁鹊心书》原书）
功效：清泻肺肾郁热
注意：石膏丸为寒凉之剂，用于肾经郁热所致的咳嗽烦躁。窦材虽以扶阳为宗，但遇真热证亦不避寒凉，体现了辨证论治的灵活性。此方证必有确切的烦热表现，不可误用于虚寒证。
金液丹：以硫黄为主药炼制而成，大热纯阳，能补命门真火，用于急救虚脱。
保命丹：功能益气固脱、回阳救逆。
姜附汤：干姜、附子，大辛大热，回阳救逆、温补脾肾。
用法：三药配合，汤药并进，配合灸关元，为劳咳危证之急救方案。
"大凡咳嗽者，忌服凉药，犯之必变他证，忌房事，恐变虚劳。"
以咳嗽、流清涕为主症者，对应"肺感风寒"证，可用华盖散加减。临床表现为恶寒发热、头痛鼻塞、流清涕、咳嗽痰白稀者，以宣肺散寒为法。
咳嗽伴恶心呕吐、胸脘痞闷者，对应"外感风寒、内伤生冷"证，可用五膈散加减。现代医学中的胃肠型感冒、急性支气管炎伴消化不良者适用。
久咳不愈、气短乏力、动则喘甚者，接近"劳咳"范畴，当从脾肾论治，艾灸关元、天突等穴，配合温补脾肾之方。临床可用金液丹、姜附汤类加减（需严格控制适应症）。
喉中痰鸣如风吼声、遇冷或劳累加重者，对应"咳病/哮喘"篇，可灸天突、中脘，并服五膈散加减。
以顽固性干咳为主要表现，无明显喘息，遇冷或刺激性气味加重者，可从"肺感风寒"或"外寒内伤"论治，灸天突穴有良效。
"无如医者辄以芩知桑杏为要药，致肺气冰伏，脾肾虚败，及至用补又不过以四君、六味和平之剂、和平之药与之，所谓养杀而已。"
释义：没有比那些庸医动辄以黄芩、知母、桑白皮、杏仁为治咳要药更糟糕的了，这样会导致肺气被寒凉冰伏，脾肾阳气虚衰败绝。等到需要补益时，又不过是用四君子汤、六味地黄丸等平和的方剂，这真所谓是"养杀"——看似在调养，实则是在慢慢断送患者的生机。
扁鹊心书论咳嗽虽然文字简短，但内涵极为丰富。窦材将咳嗽分为三证，看似简单，实则涵盖了表证（肺感风寒）、表里同病（外寒内伤）、里证（肾虚烦躁）三个层次，体现了由表入里、由浅入深的辨证思路。
特别值得注意的是，窦材对"劳咳"的论述，与现代医学中慢性心力衰竭导致的肺水肿、恶液质状态下的终末期咳嗽有颇多相似之处。"额上汗出"是交感神经代偿性兴奋的表现，"四肢微冷"是末梢循环衰竭的征象，"发热困倦"可能与感染或肿瘤热有关。窦材提出的急灸关元、姜附回阳之法，本质上是通过强心、改善循环来挽救危局，这与现代医学对心衰的急救思路在原理上相通。
对于临床常见慢性咳嗽，窦材"忌凉药"的思想尤其值得重视。当今临床上滥用抗生素、清热解毒类中药治疗咳嗽的现象仍然普遍，导致咳嗽迁延不愈甚至加重者屡见不鲜。窦材强调"肺气冰伏，脾肾虚败"的警示，在抗生素和寒凉中药滥用的今天，仍然具有深刻的现实意义。
咳嗽灸天突是扁鹊心书的特色疗法之一。天突穴位于胸骨上窝，深部为气管，灸之可直接作用于气道，改善局部气血循环，缓解气道痉挛，是治疗咳嗽、哮喘的经验效穴。临床实践中，艾条悬灸天突穴10-15分钟，对风寒咳嗽、过敏性咳嗽、咳嗽变异性哮喘均有较好疗效。