伤寒由毛窍而入，自下而上，始于足太阳。温病由口鼻而入，自上而下，始于手太阴。伤寒以六经传变为主，温病以三焦传变为纲。伤寒以发表为先，温病以逐秽为急。伤寒之邪，留着于肌肤；温病之邪，盘踞于膜原。伤寒伤人身之阳，温病伤人之阴。此其大较也。
伤寒病邪从皮肤毛孔侵入人体，由下向上传变，起始于足太阳膀胱经。温病病邪从口鼻侵入人体，由上向下传变，起始于手太阴肺经。伤寒以六经传变规律为主，温病以三焦传变规律为纲领。伤寒治疗以发汗解表为首要方法，温病治疗以逐除秽浊为急务。伤寒的病邪停留在肌肤表层，温病的病邪盘踞在膜原（胸膜与膈肌之间）。伤寒损伤人体的阳气，温病损伤人体的阴液。这就是伤寒与温病的大体区别。
上焦篇第58条是《温病条辨》上焦篇的总结性条文，吴鞠通在此条中以对比的方式，提纲挈领地阐述了伤寒与温病的根本区别，为全书的辨证体系奠定了理论基础。本条虽篇幅不长，但字字珠玑，是理解温病学区别于伤寒学的关键所在。
| 比较维度 | 伤寒 | 温病 |
|---|---|---|
| 侵入途径 | 由毛窍而入（皮毛） | 由口鼻而入（呼吸道） |
| 传变方向 | 自下而上 | 自上而下 |
| 起始经络 | 足太阳膀胱经 | 手太阴肺经 |
| 传变体系 | 六经传变 | 三焦传变 |
| 治疗大法 | 发表为先 | 逐秽为急 |
| 邪气部位 | 留着于肌肤 | 盘踞于膜原 |
| 伤损方向 | 伤人身之阳 | 伤人之阴 |
上焦篇共58条，涵盖风温、温热、温疫、温毒、暑温、湿温、秋燥等多种温病类型，系统阐述了温病在上焦阶段的辨证论治体系。以下是上焦篇的核心内容总结：
风温初起，邪在手太阴肺经，以银翘散、桑菊饮为主方。热入气分则用白虎汤类，热入营血则用清营汤、犀角地黄汤。强调"治上焦如羽，非轻不举"的用药原则，用药宜轻清宣透。
温疫邪气秽浊，传变迅速，治以逐秽解毒为急。强调芳香化浊、清热解毒之法，代表方如普济消毒饮等。注重透邪外出，避免闭门留寇。
暑温多夹湿，易伤气阴。初起以清暑化湿为法，代表方如新加香薷饮、白虎加苍术汤等。暑温入营则用清营汤。强调暑易伤气，须顾护气阴。
湿温病势缠绵，以三仁汤为代表方，宣畅气机、渗利湿热。强调"湿温三禁"：禁汗、禁下、禁润。治疗以分解湿热为要务。
秋燥有温凉之别，上焦阶段以肺燥为主。温燥用桑杏汤、凉燥用杏苏散。强调"燥者润之"的治疗原则，用药宜甘寒滋润。
综合对比伤寒与温病的区别，明确温病辨证体系的理论基础，为后续中焦篇、下焦篇的深入论述提供纲领性指导。
吴鞠通创立的"三焦辨证"体系，与叶天士的"卫气营血辨证"相辅相成，共同构成了温病学的核心辨证框架。三焦辨证侧重于从纵向（上、中、下三焦）把握温病的发展阶段和脏腑定位，卫气营血辨证侧重于从横向（卫、气、营、血四个层次）把握温病的深浅轻重。两者纵横交织，形成了温病辨证的立体网络。
上焦篇的核心贡献在于：明确了温病的病因、入侵途径（口鼻而入）、初期病位（手太阴肺）、传变方向（自上而下），以及各类温病在上焦阶段的证治方药。特别是第58条对伤寒与温病的比较，从根本上澄清了两种外感病的本质区别，为温病学独立于伤寒学体系奠定了理论基础。
上焦篇所述的各种温病类型及其治法，在临床上有广泛的指导意义。以下从各主要温病类型的临床应用角度进行阐述：
根据上焦篇的论述，治疗上焦温病有"三禁"需要注意：
"伤寒是寒邪，由毛窍而入，始于足太阳经，自下而上，以六经为纲；温病是热邪，由口鼻而入，始于手太阴经，自上而下，以三焦为纲。此伤寒与温病之大关键也。" —— 吴鞠通《温病条辨》自注
"鞠通此条，将伤寒与温病之异同，条分缕析，提纲挈领。学者能于此条反复玩味，则全书之大旨已过半矣。" —— 王孟英《温热经纬》引注
"治上焦如羽，非轻不举。上焦部位最高而近表，药味宜取清扬轻浮之品，使药力直达病所而邪从表解。银翘散、桑菊饮即为此设。" —— 清代医家对《温病条辨》上焦篇治则的阐释