本篇《阴阳离合论》是《黄帝内经》第六篇，深入探讨了阴阳离合的本质规律，特别是三阳三阴之离合关系，以及开、合、枢的运作机制。倪海厦老师通过人体横隔分界、经络井穴、中药西药对比等具体实例，揭示了阴阳离合在中医理论和临床实践中的核心地位。
阴阳离合的核心原则是：未出地者，名曰阴中之阴；则出地者，名曰阴中之阳。在人体中，横隔膜成为天然的阴阳分界：
倪海厦老师形象地将横隔比喻为"地表"，横隔以上是"地上"，横隔以下是"地下"，肾脏像种子埋在土中，肝脾在土层中生长。
"如果中间这个横隔我们把它当成地表，那这个就是地下了，这是地上嘛，对不对，地上和地下，所以说肝脏在这边，脾脏在这边，肾脏这是在底下，两个种子埋在土底下。"
人体的生长收藏遵循自然规律：
失常则天地四塞，阴阳之变，在人者亦数之可数。
三条阳经的根源都在脚部的井穴，体现了"阴中之阳"的特性：
三条阳经都从地下（脚部）开始，向上生长，符合"阴中之阳"的原则。
太阳是人体与自然界之间的门户，主管"开"的功能。如早上眼睛睁开，阳气开始活动。
少阳是门的枢纽，主管运输和转换。如开始刷牙漱口、日常活动，阴阳在体内运行依靠少阳的转运功能。
阳明主管收阖，如晚上眼睛闭合，阳气收敛。阳明有问题则不能正常睡眠。
"你看，早上起来眼睛一打开，太阳开了嘛，眼睛就开了，那太阳开嘛，开始刷牙漱口，开始动作，少阳。忙了一天到晚上回家眼睛一闭起来，阖，对不对，这，对，那你阳明有问题的时候那不能睡觉了。"
三阳互相配合，相辅相成，统称为"一阳"，共同完成一个完整的阳气活动周期。
太阴（脾经）根起于隐白穴，是阴中之阴。横隔以下属于太阴的范围，主管"开"的功能。
少阴（肾经）根起于涌泉穴，是阴中之少阴，主管传导输送的枢纽功能。
厥阴（肝经）根起于大敦穴，是阴之绝阴，主管收阖，在最底线、最里面合住。
三阴之间是"分开来又合在一起"的关系：三条不同的经络，但是合在一起的一个功能，互相制衡，所以称为"离合"。"离"就是不同的东西，"合"就是放在一起合作。
《黄帝内经》提出最重要的原则："搏而勿沉"，即绝对不可以有东西沉积在体内。这是中药与西药的根本区别：
"我们是中药里面吃下去以后在身体里面不会累积，西药不一样，你吃一个抗生素在肝脏里面可能待了27年，还没排出来，中药很快就排掉了。"
自然界不产生纯营养，所有天然食物都包含排泄辅助成分：
"自然界在天地六合之内没有一样东西是纯营养的，自然界不产生纯营养，因为纯营养会累积啊，所谓新陈代谢，新的去换旧的。"
本篇为张仲景《伤寒论》提供了直接的理论基础：
倪海厦老师强调，学过针灸的人看《黄帝内经》会很简单，否则连"厉兑"这样的穴位名称都可能误以为是《易经》的兑卦。
《阴阳离合论》不仅解释了阴阳的基本规律，更提供了中医临床的重要指导原则：
阴阳离合理论体现了中医的整体观和动态平衡思想，阴阳既分离又合作，既对立又统一，这种辩证关系是中医理论的精髓。